Der Hauptentwickler von Assassins Creed Shadows versichert den Spielern, dass die Auswahl eines einzelnen Protagonisten ihre Erfahrungen nicht wesentlich beeinflussen wird. Das Spiel enthält zwei spielbare Charaktere: Naoe, eine weibliche Shinobi, und Yasuke, eine historische afrikanische Samurai, deren Aufnahme eine Diskussion vor der Veröffentlichung hervorgebracht hat.
Es ergaben Bedenken, dass die Konzentration auf einen Charakter zu verpassten Story -Elementen oder zu Gameplays führen könnte. Der Kreativdirektor Jonathan Dumont sprach diese Bedenken an und beschrieb seinen eigenen ausgewogenen Ansatz: Er wechselt zwischen Charakteren und spielte 3-5 Stunden mit einem, bevor er 2-3 Stunden lang zum anderen wechselte.
Dumont stellte jedoch klar, dass die Spieler durch die Bevorzugung eines Charakters nicht wesentlich benachteiligt werden. Während jeder Protagonist einzigartige Eröffnungssequenzen und persönliche Handlungsstränge aufweist, passt sich die Kernerzählung an die Wahl des Spielers an. Er ermutigt die Spieler, als ihren bevorzugten Charakter zu spielen:
"Ich glaube nicht Favorit, und die Geschichte wird dem Beispiel folgen. "
