Nhà phát triển chính của Assassin Creed Shadows đảm bảo cho người chơi rằng việc chọn một nhân vật chính sẽ không ảnh hưởng đáng kể đến trải nghiệm của họ. Trò chơi có hai nhân vật có thể chơi được: Naoe, một nữ Shinobi và Yasuke, một Samurai châu Phi lịch sử, người đã đưa ra cuộc thảo luận trước khi phát hành.
Mối quan tâm nảy sinh rằng việc tập trung vào một nhân vật có thể dẫn đến các yếu tố câu chuyện bị bỏ lỡ hoặc trò chơi. Giám đốc sáng tạo Jonathan Dumont đã giải quyết những mối quan tâm này, mô tả cách tiếp cận cân bằng của riêng mình: anh ấy xen kẽ giữa các nhân vật, chơi 3-5 giờ với một trước khi chuyển sang người kia trong 2-3 giờ.
Tuy nhiên, Dumont làm rõ rằng người chơi sẽ không bị thiệt thòi đáng kể khi ủng hộ một nhân vật. Trong khi mỗi nhân vật chính tự hào có các chuỗi mở đầu và cốt truyện cá nhân duy nhất, thì câu chuyện cốt lõi thích nghi với sự lựa chọn của người chơi. Anh ấy khuyến khích người chơi chơi như một nhân vật ưa thích của họ:
"Tôi không tin rằng bạn sẽ bỏ lỡ nhiều. Nó phụ thuộc vào phong cách chơi của bạn. Thử nghiệm và xem cách trò chơi điều chỉnh lựa chọn nhân vật của bạn. Mỗi anh hùng có giới thiệu và nhiệm vụ riêng, nhưng trải nghiệm chính vẫn thích nghi. Yêu thích, và câu chuyện sẽ làm theo. "
